Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Itga6Q61739 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga6Q61739 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms