Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcolceQ61398 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms