Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnna2Q61301 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnna2Q61301 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna2Q61301 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms