Protein–RNA interactions for Protein: Q61084

Map3k3, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k3Q61084 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Map3k3Q61084 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Map3k3Q61084 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms