Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxd3Q61060 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms