Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf3Q60980 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf3Q60980 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms