Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnot7Q60809 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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