Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sik1Q60670 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sik1Q60670 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms