Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NotoQ5TIS6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NotoQ5TIS6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NotoQ5TIS6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NotoQ5TIS6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NotoQ5TIS6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NotoQ5TIS6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NotoQ5TIS6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NotoQ5TIS6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NotoQ5TIS6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NotoQ5TIS6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NotoQ5TIS6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NotoQ5TIS6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NotoQ5TIS6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NotoQ5TIS6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NotoQ5TIS6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NotoQ5TIS6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NotoQ5TIS6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NotoQ5TIS6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NotoQ5TIS6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NotoQ5TIS6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NotoQ5TIS6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NotoQ5TIS6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NotoQ5TIS6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NotoQ5TIS6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NotoQ5TIS6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NotoQ5TIS6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NotoQ5TIS6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NotoQ5TIS6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NotoQ5TIS6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NotoQ5TIS6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NotoQ5TIS6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms