Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms