Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r196Q5SVD5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r196Q5SVD5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms