Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

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Length 1,306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SynrgQ5SV85 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SynrgQ5SV85 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms