Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Utp18Q5SSI6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms