Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms