Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Taf3Q5HZG4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf3Q5HZG4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Taf3Q5HZG4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Taf3Q5HZG4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms