Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnni3kQ5GIG6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnni3kQ5GIG6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 204 ms