Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trpm3Q5F4S9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpm3Q5F4S9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms