Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrc3Q5DU56 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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