Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rtl5Q5DTT4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rtl5Q5DTT4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms