Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syce1lQ5D525 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syce1lQ5D525 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syce1lQ5D525 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syce1lQ5D525 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syce1lQ5D525 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syce1lQ5D525 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syce1lQ5D525 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms