Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2f8Q58FA4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2f8Q58FA4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2f8Q58FA4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2f8Q58FA4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2f8Q58FA4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2f8Q58FA4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2f8Q58FA4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2f8Q58FA4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms