Protein–RNA interactions for Protein: Q56A08

Gpkow, G-patch domain and KOW motifs-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpkowQ56A08 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GpkowQ56A08 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms