Protein–RNA interactions for Protein: Q504N7

Pyrin and HIN domain-containing protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q504N7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q504N7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q504N7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q504N7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q504N7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q504N7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q504N7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q504N7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q504N7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q504N7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q504N7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q504N7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q504N7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q504N7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q504N7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q504N7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q504N7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q504N7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q504N7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q504N7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q504N7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q504N7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q504N7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q504N7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q504N7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q504N7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q504N7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q504N7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q504N7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q504N7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q504N7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q504N7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q504N7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q504N7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q504N7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q504N7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q504N7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q504N7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q504N7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q504N7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q504N7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q504N7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q504N7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q504N7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q504N7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q504N7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q504N7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q504N7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q504N7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q504N7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q504N7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q504N7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q504N7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q504N7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q504N7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q504N7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q504N7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q504N7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q504N7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q504N7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q504N7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q504N7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q504N7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q504N7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q504N7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q504N7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q504N7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q504N7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q504N7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q504N7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q504N7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q504N7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q504N7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q504N7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q504N7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q504N7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q504N7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q504N7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q504N7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q504N7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q504N7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q504N7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q504N7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q504N7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q504N7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q504N7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q504N7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q504N7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Q504N7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q504N7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q504N7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q504N7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q504N7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q504N7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q504N7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q504N7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q504N7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q504N7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q504N7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q504N7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms