Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc84Q4VA36 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc84Q4VA36 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc84Q4VA36 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms