Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc3lQ4KL14 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc3lQ4KL14 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms