Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Brinp3Q499E0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Brinp3Q499E0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms