Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Carmil2Q3V3V9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Carmil2Q3V3V9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Carmil2Q3V3V9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Carmil2Q3V3V9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Carmil2Q3V3V9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Carmil2Q3V3V9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Carmil2Q3V3V9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Carmil2Q3V3V9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Carmil2Q3V3V9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Carmil2Q3V3V9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Carmil2Q3V3V9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Carmil2Q3V3V9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Carmil2Q3V3V9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Carmil2Q3V3V9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Carmil2Q3V3V9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Carmil2Q3V3V9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Carmil2Q3V3V9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Carmil2Q3V3V9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Carmil2Q3V3V9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Carmil2Q3V3V9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Carmil2Q3V3V9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Carmil2Q3V3V9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Carmil2Q3V3V9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Carmil2Q3V3V9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Carmil2Q3V3V9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Carmil2Q3V3V9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Carmil2Q3V3V9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Carmil2Q3V3V9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Carmil2Q3V3V9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Carmil2Q3V3V9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Carmil2Q3V3V9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Carmil2Q3V3V9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Carmil2Q3V3V9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Carmil2Q3V3V9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Carmil2Q3V3V9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Carmil2Q3V3V9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Carmil2Q3V3V9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Carmil2Q3V3V9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms