Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ckap2Q3V1H1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms