Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0V0

Ldlrad2, Low density lipoprotein receptor A domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad2Q3V0V0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ldlrad2Q3V0V0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms