Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd53Q3V0J4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd53Q3V0J4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd53Q3V0J4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd53Q3V0J4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd53Q3V0J4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd53Q3V0J4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd53Q3V0J4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd53Q3V0J4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd53Q3V0J4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd53Q3V0J4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd53Q3V0J4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd53Q3V0J4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd53Q3V0J4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd53Q3V0J4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd53Q3V0J4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd53Q3V0J4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd53Q3V0J4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd53Q3V0J4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd53Q3V0J4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd53Q3V0J4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd53Q3V0J4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd53Q3V0J4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd53Q3V0J4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd53Q3V0J4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd53Q3V0J4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd53Q3V0J4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd53Q3V0J4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd53Q3V0J4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ankrd53Q3V0J4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd53Q3V0J4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms