Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dnaaf3Q3UYV8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms