Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn4Q3UWL8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn4Q3UWL8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn4Q3UWL8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn4Q3UWL8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn4Q3UWL8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn4Q3UWL8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn4Q3UWL8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn4Q3UWL8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn4Q3UWL8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn4Q3UWL8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn4Q3UWL8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn4Q3UWL8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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