Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clca4bQ3UW98 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms