Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW31

Pate2, Prostate and testis expressed protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate2Q3UW31 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pate2Q3UW31 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pate2Q3UW31 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pate2Q3UW31 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pate2Q3UW31 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pate2Q3UW31 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pate2Q3UW31 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pate2Q3UW31 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pate2Q3UW31 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pate2Q3UW31 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pate2Q3UW31 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pate2Q3UW31 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pate2Q3UW31 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pate2Q3UW31 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pate2Q3UW31 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pate2Q3UW31 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pate2Q3UW31 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pate2Q3UW31 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pate2Q3UW31 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pate2Q3UW31 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pate2Q3UW31 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pate2Q3UW31 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pate2Q3UW31 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pate2Q3UW31 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pate2Q3UW31 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pate2Q3UW31 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pate2Q3UW31 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pate2Q3UW31 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pate2Q3UW31 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pate2Q3UW31 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pate2Q3UW31 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pate2Q3UW31 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pate2Q3UW31 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pate2Q3UW31 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pate2Q3UW31 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms