Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUY6

Prom2, Prominin-2, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom2Q3UUY6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Prom2Q3UUY6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms