Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chpf2Q3UU43 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms