Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Obox3Q3UT54 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Obox3Q3UT54 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms