Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
B230104I21RikQ3USW4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
B230104I21RikQ3USW4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
B230104I21RikQ3USW4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
B230104I21RikQ3USW4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
B230104I21RikQ3USW4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
B230104I21RikQ3USW4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
B230104I21RikQ3USW4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
B230104I21RikQ3USW4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms