Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtl4Q3URY0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms