Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acsf3Q3URE1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms