Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrc1Q3UPH1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc1Q3UPH1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms