Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nhlrc4Q3UP44 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nhlrc4Q3UP44 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms