Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmem253Q3UNB8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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