Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cobll1Q3UMF0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms