Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrxosQ3UL53 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CrxosQ3UL53 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CrxosQ3UL53 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms