Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E330014E10RikQ3UL33 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E330014E10RikQ3UL33 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms