Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smu1Q3UKJ7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms