Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttll12Q3UDE2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttll12Q3UDE2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttll12Q3UDE2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttll12Q3UDE2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttll12Q3UDE2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttll12Q3UDE2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttll12Q3UDE2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttll12Q3UDE2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttll12Q3UDE2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttll12Q3UDE2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttll12Q3UDE2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttll12Q3UDE2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttll12Q3UDE2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttll12Q3UDE2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttll12Q3UDE2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttll12Q3UDE2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttll12Q3UDE2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttll12Q3UDE2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttll12Q3UDE2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttll12Q3UDE2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttll12Q3UDE2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttll12Q3UDE2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttll12Q3UDE2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttll12Q3UDE2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttll12Q3UDE2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttll12Q3UDE2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttll12Q3UDE2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttll12Q3UDE2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttll12Q3UDE2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttll12Q3UDE2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttll12Q3UDE2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttll12Q3UDE2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ttll12Q3UDE2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttll12Q3UDE2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms