Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rnf180Q3U827 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf180Q3U827 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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Rnf180Q3U827 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
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