Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3U6N9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3U6N9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3U6N9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3U6N9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3U6N9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3U6N9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3U6N9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U6N9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U6N9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms